Šolo upravljata ravnatelj in Svet šole OŠ Prežihovega Voranca. Svet ima štiriletni mandat, sestavljajo ga trije predstavniki ustanovitelja, trije predstavniki staršev in pet predstavnikov šole.
Predstavnike staršev je v Svet izvolil Svet staršev OŠ Prežihovega Voranca, ki ga sestavljajo predstavniki staršev iz vsakega posameznega oddelka.
Strokovni organi šole so: učiteljski zbor, oddelčni učiteljski zbor, strokovni aktivi in razredniki.
Učenci so organizirani v oddelčne skupnosti in volijo dva predstavnika oddelka v skupnost učencev šole, ki sprejme letni program dela. Izvršilni organ skupnosti učencev je šolski parlament.
Za red na šoli, predvsem pri vhodu v stavbo, bo skrbel receptor, dežurali pa bodo tudi učenci 7., 8. in 9. razredov.
